Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms