Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnrc6bQ8BKI2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms