Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup93Q8BJ71 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup93Q8BJ71 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms