Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms