Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timm29Q8BGX2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm29Q8BGX2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms