Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Bhlhe23Q8BGW3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms