Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg4dQ8BGV9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms