Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pknox2Q8BG99 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms