Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trmt12Q8BG71 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms