Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdspl2Q8BG15 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdspl2Q8BG15 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms