Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc50Q810U5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms