Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms