Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NanogQ80Z64 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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