Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm5bQ80Y84 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5bQ80Y84 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms