Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atg2bQ80XK6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atg2bQ80XK6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atg2bQ80XK6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms