Protein–RNA interactions for Protein: Q80W47

Wipi2, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipi2Q80W47 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wipi2Q80W47 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wipi2Q80W47 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms