Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WhrnQ80VW5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms