Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rpp38Q80UU2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpp38Q80UU2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpp38Q80UU2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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