Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sestd1Q80UK0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sestd1Q80UK0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms