Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms