Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Avl9Q80U56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms