Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
NischQ80TM9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NischQ80TM9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NischQ80TM9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms