Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rexo1Q7TT28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo1Q7TT28 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms