Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2q1Q7TSS2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2q1Q7TSS2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms