Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ckap2lQ7TS74 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms