Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms