Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nphp3Q7TNH6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms