Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shq1Q7TMX5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms