Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SyncripQ7TMK9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SyncripQ7TMK9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms