Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg4Q7TMD7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg4Q7TMD7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg4Q7TMD7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg4Q7TMD7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms