Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms