Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Sys1Q78S06 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sys1Q78S06 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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