Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snd1Q78PY7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms