Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnih3Q6ZWS4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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