Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfflQ6ZQM0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms