Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Topbp1Q6ZQF0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Topbp1Q6ZQF0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms