Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms