Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms