Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcl3Q6W5C0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl3Q6W5C0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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