Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rhox8Q6VSS7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rhox8Q6VSS7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms