Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gja6Q6S5G4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms