Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc154Q6RUT8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc154Q6RUT8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms