Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt9Q6RHW0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms