Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms