Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms