Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms