Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhb9Q6PB60 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms