Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fhod1Q6P9Q4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fhod1Q6P9Q4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms