Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyp2d40Q6P8N9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms