Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd2Q6NXI6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms